Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r194J3JS27 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r194J3JS27 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms