Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp408H7BX78 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms