Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r6H3BK29 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r6H3BK29 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms