Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pabpc4lG5E8X2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc4lG5E8X2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc4lG5E8X2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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