Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnf148G3X9R7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf148G3X9R7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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