Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34aG3UW52 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34aG3UW52 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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