Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20517G3UVU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms