Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Srp72F8VQC1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp72F8VQC1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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