Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3371F7CQW8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms