Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms