Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm340F6RGI3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms