Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc7bE9Q9Y3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc7bE9Q9Y3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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