Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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BC051665E9Q623 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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BC051665E9Q623 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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BC051665E9Q623 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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BC051665E9Q623 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC051665E9Q623 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms