Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancfE9Q5Z5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms