Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BC005561E9Q5E2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BC005561E9Q5E2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC005561E9Q5E2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms