Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trip11E9Q512 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip11E9Q512 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms