Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Hectd4E9Q2E4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Hectd4E9Q2E4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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