Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms