Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf11E9PZM7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf11E9PZM7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms