Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Srp54bE9PXC0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms