Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc175E9PVB3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms