Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga1E1U8D0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms