Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rdh8D3Z6W3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms