Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms