Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samd1D3YXK1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms