Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ube2d4D3YUH6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ube2d4D3YUH6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms