Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmf1B9EKI3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmf1B9EKI3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms