Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11bB4XVQ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf11bB4XVQ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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