Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11cB4XVP9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms