Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cfap58B2RW38 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms