Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5483B2RV77 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5483B2RV77 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms