Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtprbB2RU80 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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