Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrt4B2RU40 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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