Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zscan5bB2RTN3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zscan5bB2RTN3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms