Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apol7aB2RT54 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms