Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Otud4B2RRE7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms