Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CK137956B1AYM9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CK137956B1AYM9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms