Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm14862B1AV28 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm14862B1AV28 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm14862B1AV28 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm14862B1AV28 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm14862B1AV28 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm14862B1AV28 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms