Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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