Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PtprsB0V2N1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PtprsB0V2N1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtprsB0V2N1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtprsB0V2N1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PtprsB0V2N1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprsB0V2N1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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