Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint5A7XUY5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint5A7XUY5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint5A7XUY5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint5A7XUY5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint5A7XUY5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint5A7XUY5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint5A7XUY5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms