Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-M5A7VMS3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms