Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms