Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plcb2A3KGF7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plcb2A3KGF7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plcb2A3KGF7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Plcb2A3KGF7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plcb2A3KGF7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plcb2A3KGF7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plcb2A3KGF7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms