Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lgr4A2ARI4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lgr4A2ARI4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms