Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syndig1A2ANU3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms