Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Frmpd1A2AKB4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Frmpd1A2AKB4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms