Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm12A2AJ77 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms