Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ckap5A2AGT5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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