Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc163A2AGD7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms